為提升調查、分析、保育等各項工作項目之執行品質，本會邀集相關領域經驗之學者專家加入顧問團，匯聚各方專業知識與實務經驗，提升本會視野與能量。
名譽理事長
| 姓名 | 服務單位 | 專長 / 領域 |
|---|---|---|
| 呂光洋 | 國立台灣師範大學生命科學系 名譽教授 | 兩棲爬行動物、生態學、演化生物學 |
專家顧問團
以下名單依筆畫順序排列，更新於：2020.09.01
| 姓名 | 服務單位 | 專長 / 領域 |
|---|---|---|
| 向高世 | 銘傳大學生物科技學系 副教授 | 生態學、動物田野調查、兩棲爬行動物學 |
| 巫奇勳 | 文化大學生命科學系 副教授 | 動物生理生態學、兩棲爬行動物學、生物資源與保育 |
| 周文豪 | 國立自然科學博物館 教授 | 生態學、生物地理 |
| 林思民 | 國立臺灣師範大學生命科學系 教授 | 脊椎動物學、保育遺傳學、分子演化學 |
| 林春富 | 行政院農業委員會特有生物研究保育中心 研究員 | 兩棲類動物學、生理生態學 |
| 林德恩 | 行政院農業委員會特有生物研究保育中心 研究員 | 兩棲爬行類（溫度生理、生殖週期、族群動態、動物行為、生物統計、演化生物） |
| 林曜松 | 國立臺灣大學生命科學系 名譽教授 | 野生動物保育 |
| 邱銘源 | 春雷創意顧問有限公司 副執行長 | 道路生態工法 |
| 張東君 | 財團法人臺北動物園保育教育基金會 秘書組組長 | 動物行為學、動物生態學、兩棲爬蟲學、科普寫作 |
| 莊孟憲 | 蛙趣自然生態顧問有限公司 負責人 | 生物學、生態學、社區參與 |
| 莊銘豐 | 國立中興大學生命科學系 助理研究員 | 脊椎動物學、保育生物學、動物聲學、動物行為學 |
| 許富雄 | 國立嘉義大學生物資源學系 副教授 | 動物行為學、族群生態學、野生動物資源 |
| 陳王時 | 伯驊印刷有限公司 負責人 | 鳥類、蝴蝶、蛙類 |
| 陳怡惠 | 中國文化大學生命科學系 副教授 | 分子生態學、動物行為學、脊椎動物學 |
| 陳瑞賓 | 社團法人台灣環境資訊協會 秘書長 | 生態學、非營利組織經營管理 |
| 陳賜隆 | 臺北市立動物園保育研究中心 輔導員 | 兩棲爬蟲分類、生物地理、生態學、動物行為 |
| 黃文山 | 國立自然科學博物館 館長 | 爬蟲類生態、行為演化生態學、生殖生態學、族群生態學、環境變遷對島嶼爬蟲類（蜥蜴和蛇）生態的衝擊、島嶼爬蟲類生態學 |
| 劉建男 | 國立嘉義大學森林暨自然資源學系 助理教授 | 野生動物生態學、動物生理學、生物多樣性保育、保護區經營管理 |